静音式柴油发电机组的冷却方式有风冷以及水冷两种，风冷却方式是以空气作为冷却介质，把静音柴油发电机组受热零部件的热量传送出去，这种冷却方式由散热风扇以及导罩等组成；水冷却方式是用水作为冷却介质，把静音柴油发电机组受热零件的热量传达出去，其特点是当气温或者工作负载变化的时候，便利调节冷却强度。
风冷却方式：为了增强散热棉结，往往在气缸体、气缸盖以及各个散热器上的外壁都铸有许多皱折状的散热片。
工作的时候风扇转动把空气沿导风罩流向气缸体和气缸盖表面，冷空气流经散热片的时候，把气缸体以及气缸盖付出的热量带走。
风冷式冷却系统结构简单，质量较减小，可是冷却效果差，多用于小型静音柴油发电机组，适合缺水地区。
水冷却方式：有开式以及闭式两种。
开式冷却系统中，循环水直接与和大气相通，冷却系统内的蒸汽压力总是保持为大气压力。
闭式系统中，水在密闭系统内循环，冷却系统的蒸压力比大气压力大，因为冷却水温和外界气温温差增加，所以提升了整个冷却系统的散热能力。
风冷静音式柴油发电机组最大的优势就是结构简略、利于庇护、故障率低、发起性能好，所需空气量少，更易实现关闭，热效率高，电扇耗费功率低，油耗也较低，没有冻裂或过热沸腾风险，但受到热负荷和机械负荷约束。
而水冷柴油发电机组的效率高，降温来得快，从而使机体自身的功率转化率得到提高。
